More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6945 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6945  putative DedA protein  100 
 
 		 330 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.972654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2986  putative DedA protein  95.76 
 
 		 330 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4266  rhodanese domain-containing protein  76.67 
 
 		 329 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.987419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5407  rhodanese domain-containing protein  68.14 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4860  rhodanese domain-containing protein  67.82 
 
 		 330 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.722599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3269  rhodanese domain-containing protein  66.04 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119092  normal  0.0431864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4736  rhodanese domain-containing protein  66.25 
 
 		 330 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5324  rhodanese-like protein  66.25 
 
 		 330 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5536  rhodanese domain-containing protein  66.25 
 
 		 330 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2213  dedA family protein  65.85 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0770256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0392  dedA family protein  64.94 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.911843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0358  dedA family protein  64.94 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1247  integral-membrane protein  64.94 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0121  DedA family protein  66.25 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00355931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2896  hypothetical protein  64.94 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3012  hypothetical protein  64.94 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00280754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1541  dedA family protein  64.94 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.158432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1731  dedA family protein  64.94 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096673  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00135  DedA family protein  54.14 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2409  putative DedA protein  49.84 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230239  normal  0.723786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5566  rhodanese domain-containing protein  45.82 
 
 		 325 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.785557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6689  DedA family protein  49.13 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  38.49 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  38.56 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_003296  RS00824  hypothetical protein  39.69 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4725  Rhodanese domain protein  39.38 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5534  normal  0.040028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3648  Rhodanese domain protein  39.38 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  38.08 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5537  hypothetical protein  38.89 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.4014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  40.32 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0949  putative transmembrane protein  37.67 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5938  hypothetical protein  35.89 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000315841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4673  putative transmembrane protein  38.41 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48660  hypothetical protein  40.21 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3995  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6646  rhodanese domain-containing protein  36.48 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0225208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4169  hypothetical protein  40.21 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4252  uncharacterized membrane-associated protein  36.04 
 
 		 362 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4252  rhodanese domain-containing protein  35.08 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3998  uncharacterized membrane-associated protein  36.36 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3778  rhodanese domain-containing protein  35.08 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4369  uncharacterized membrane-associated protein  36.36 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5985  uncharacterized membrane-associated protein  36.36 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1648  uncharacterized membrane-associated protein  35.08 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400547  normal  0.120635 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1564  dedA family protein  35.95 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.838864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0711  dedA family protein  35.06 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1715  dedA family protein  35.06 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0751  dedA family protein  35.06 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1237  DedA family protein  35.06 
 
 		 362 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2433  dedA family protein  35.62 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1162  hypothetical protein  35.62 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3852  rhodanese domain-containing protein  32.9 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1389  hypothetical protein  36.93 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831518  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4308  putative DedA-like transmembrane protein  31.07 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501524  normal  0.760062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0639  putative DedA-like transmembrane protein  31.55 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3050  hypothetical protein  35.19 
 
 		 268 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  28.93 
 
 		 208 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0874  hypothetical protein  34.45 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000956069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.3 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  27.09 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  28 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  28 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  28 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  28 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  30.32 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  26.6 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.92 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  27.43 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  27.43 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  33.12 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  24.54 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  30.14 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.48 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  30.3 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  31.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  26.35 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  32.12 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  26.19 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  32.12 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  26.79 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  30.52 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30.52 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  30.52 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  30.52 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  30.52 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  30.52 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  27.33 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  25.3 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25 
 
 		 702 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  28.31 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>