73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0363 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  100 
 
 
633 aa  1303    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  92.89 
 
 
633 aa  1216    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  47.47 
 
 
632 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  46.05 
 
 
635 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  47.88 
 
 
641 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  46.24 
 
 
638 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  47.38 
 
 
638 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  46.7 
 
 
634 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  44.78 
 
 
639 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  46.53 
 
 
634 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  46.96 
 
 
637 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  47.29 
 
 
665 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1211  hypothetical protein  48.29 
 
 
588 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0441  hypothetical protein  48.36 
 
 
626 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2847  hypothetical protein  48.36 
 
 
634 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0392  hypothetical protein  48.36 
 
 
632 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2972  hypothetical protein  48.36 
 
 
626 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.463133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1772  hypothetical protein  48.36 
 
 
626 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1587  hypothetical protein  48.36 
 
 
629 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  39.42 
 
 
616 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  28.93 
 
 
647 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  28.76 
 
 
647 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  30.39 
 
 
636 aa  233  6e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  30.39 
 
 
636 aa  233  9e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  28.21 
 
 
637 aa  230  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  28.21 
 
 
637 aa  230  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  32.08 
 
 
342 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  22.39 
 
 
613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  22.39 
 
 
613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  26.32 
 
 
621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  26.32 
 
 
621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  22.18 
 
 
647 aa  111  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  22.18 
 
 
647 aa  111  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
1096 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  23.57 
 
 
1225 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  26.12 
 
 
1431 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  24.14 
 
 
753 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.88 
 
 
1256 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  26.12 
 
 
1433 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 
1256 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  23.18 
 
 
1256 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4804  hypothetical protein  27.78 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  28.44 
 
 
632 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  22.19 
 
 
664 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  25.81 
 
 
1433 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
1253 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
1338 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  21.86 
 
 
672 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  23.55 
 
 
633 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  24.26 
 
 
1042 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  21.34 
 
 
673 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  22.48 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  24.81 
 
 
621 aa  67  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  21.74 
 
 
672 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  28.89 
 
 
659 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  22.1 
 
 
624 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  23.95 
 
 
658 aa  65.1  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  20.05 
 
 
635 aa  64.3  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  26.46 
 
 
637 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  29.25 
 
 
636 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  21.55 
 
 
624 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  19.24 
 
 
667 aa  61.6  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  21.41 
 
 
1257 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  26.19 
 
 
856 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  36.26 
 
 
684 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  33.75 
 
 
1028 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  32.93 
 
 
391 aa  50.8  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  31.71 
 
 
391 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  20.34 
 
 
898 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  23.6 
 
 
667 aa  47.8  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  27.55 
 
 
840 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
336 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  29.76 
 
 
280 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>