76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7688 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
246 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  37.93 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  30.52 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  35.09 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  28.93 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  33.64 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1639  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
242 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.197359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  32.06 
 
 
253 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  30.83 
 
 
254 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  31.3 
 
 
254 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  31.3 
 
 
254 aa  62  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  30.66 
 
 
267 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  31.3 
 
 
254 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  29.34 
 
 
243 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  31.3 
 
 
254 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
252 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
262 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  30.53 
 
 
254 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
252 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  30.53 
 
 
254 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  29.77 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  30.48 
 
 
307 aa  55.8  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  25.18 
 
 
296 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  30.09 
 
 
261 aa  54.3  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
253 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  25.75 
 
 
251 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  27.83 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  31.54 
 
 
253 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  29.06 
 
 
220 aa  51.2  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
258 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  31.07 
 
 
416 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
242 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  28.44 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
262 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
265 aa  48.5  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  30.69 
 
 
575 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
277 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
266 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.03 
 
 
258 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  33.65 
 
 
252 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  23.08 
 
 
259 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  25.23 
 
 
247 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  23.97 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
265 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  28 
 
 
252 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 
254 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
246 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
251 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  31.73 
 
 
233 aa  45.1  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.95 
 
 
259 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  23.23 
 
 
269 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
261 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  35.9 
 
 
257 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  25.69 
 
 
247 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  25.4 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  28 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  24.85 
 
 
237 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.99 
 
 
503 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  24.3 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  30.51 
 
 
315 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  26 
 
 
251 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  47.37 
 
 
261 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0734  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
264 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.599547  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
219 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  20.39 
 
 
276 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  28.7 
 
 
246 aa  41.6  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  26.36 
 
 
256 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  26.55 
 
 
248 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.55 
 
 
266 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  25.37 
 
 
249 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  23 
 
 
247 aa  41.6  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  27.69 
 
 
248 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>