More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6416 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6416  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.66 
 
 
252 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  70.97 
 
 
254 aa  345  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.351238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2750  enoyl-CoA hydratase  52.87 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2907  enoyl-CoA hydratase  51.38 
 
 
271 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1330  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.71221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0245  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
260 aa  208  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1318  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
259 aa  204  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.35 
 
 
262 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0628  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
259 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.566194  normal  0.670194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 
262 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  42.67 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2157  enoyl-CoA hydratase  38.53 
 
 
257 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3420  enoyl-CoA hydratase  40.17 
 
 
261 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2913  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
270 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.944224  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5112  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
274 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.649242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4649  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 
274 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal  0.29144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1475  enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
265 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1160  enoyl-CoA hydratase  41.49 
 
 
264 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2770  enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5190  enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00117238  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5727  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0364977  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2620  enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal  0.0671536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5626  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.17 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0759622  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3023  enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346174  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1773  enoyl-CoA hydratase  39.26 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.25 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
261 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4012  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6255  short chain enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
259 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
254 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  26.12 
 
 
262 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
259 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.97 
 
 
256 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.02 
 
 
257 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
260 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
260 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
260 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 
260 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
264 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 
267 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1924  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 
272 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
264 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
257 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2485  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.88 
 
 
260 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.380203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.21 
 
 
260 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
264 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
254 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4448  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
274 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
264 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.58 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.84 
 
 
659 aa  99.4  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.7 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.93 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
260 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0406  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00846941  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7111  putative enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131077  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.83 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.25 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.75 
 
 
663 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.7 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.39 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.86 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
269 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
279 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  29.1 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  29.1 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
258 aa  95.1  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
260 aa  95.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.66 
 
 
654 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.5 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
259 aa  94  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.44 
 
 
263 aa  94  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.93 
 
 
265 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2544  enoyl-CoA hydratase  32.6 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.98 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.52 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1117  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 
259 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.83 
 
 
270 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  28.76 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.64 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>