More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3057 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  98.25 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  98.25 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  97.37 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  96.49 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  97.37 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  97.37 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  97.37 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  97.37 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  97.37 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  96.49 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  97.37 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  96.49 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  96.49 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  96.49 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  97.37 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  96.49 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  96.49 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  67.83 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  67.39 
 
 		 234 aa  290  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3552  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.94 
 
 		 236 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3228  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.07 
 
 		 236 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 222 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  49.55 
 
 		 221 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  48.88 
 
 		 291 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  48.43 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.55 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  48.66 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  48.65 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  47.3 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  47.3 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  47.09 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  45.61 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.64 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1364  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.29 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  45.95 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  45.95 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  45.95 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  45.95 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  45.95 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  45.95 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  45.95 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>