More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4959 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  94.93 
 
 		 296 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  93.92 
 
 		 296 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  94.26 
 
 		 296 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  93.9 
 
 		 296 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  93.9 
 
 		 296 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  93.9 
 
 		 296 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  84.51 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  84.85 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  84.85 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  84.51 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  84.85 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  85.32 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  84.85 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  84.85 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  75.68 
 
 		 295 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  75.34 
 
 		 295 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  72.95 
 
 		 296 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  57.91 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  56.6 
 
 		 303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  56.25 
 
 		 303 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 305 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  57.35 
 
 		 306 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  57.35 
 
 		 306 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  57.35 
 
 		 306 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  57.35 
 
 		 306 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 305 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  57.35 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  57.55 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  57.55 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  57.19 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 305 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  55.76 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 304 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  54.18 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 305 aa  251  9.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  48.81 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  48.6 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.04 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  53.45 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  43.8 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.7 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  42.96 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.48 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 341 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  35.25 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  35.25 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  34.92 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  34.92 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  34.92 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 305 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>