174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3428 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
206 aa  427  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  65.69 
 
 
199 aa  260  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.76 
 
 
208 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  56.13 
 
 
206 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.85 
 
 
206 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  50.85 
 
 
237 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  49.36 
 
 
235 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.36 
 
 
235 aa  201  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  48.79 
 
 
232 aa  185  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  47.83 
 
 
218 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  46.67 
 
 
219 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  42.33 
 
 
209 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  42.33 
 
 
209 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  44.13 
 
 
206 aa  178  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.86 
 
 
209 aa  177  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  46.89 
 
 
215 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  46.89 
 
 
215 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
205 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  42.38 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  41.78 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.72 
 
 
211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  47.6 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  51.1 
 
 
189 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  38.39 
 
 
206 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.27 
 
 
197 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.89 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.11 
 
 
216 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  39.35 
 
 
202 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.22 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  40.88 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  38.6 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  33.65 
 
 
202 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.2 
 
 
208 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  34.58 
 
 
202 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.26 
 
 
134 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  35.89 
 
 
201 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.98 
 
 
211 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  33.9 
 
 
210 aa  101  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  37.5 
 
 
196 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  33.51 
 
 
209 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  32.77 
 
 
208 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.78 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  29.79 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.79 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  36.76 
 
 
176 aa  94.4  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  25.42 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.03 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
376 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2579  heat shock protein DnaJ-like  43.75 
 
 
294 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
383 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
372 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  45.83 
 
 
330 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  42.31 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  42.31 
 
 
406 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  45.83 
 
 
374 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  38 
 
 
304 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  43.75 
 
 
373 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  43.75 
 
 
311 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  44 
 
 
317 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  45.83 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  43.75 
 
 
386 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
385 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1520  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
404 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  27.68 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.75 
 
 
324 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1829  heat shock protein DnaJ-like  43.75 
 
 
318 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  43.75 
 
 
332 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 
373 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
379 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
377 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.75 
 
 
393 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
380 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  36.54 
 
 
330 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.67 
 
 
315 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1805  heat shock protein DnaJ domain protein  38.18 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6947  chaperone protein DnaJ  40.82 
 
 
398 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0203  chaperone DnaJ domain protein  45.83 
 
 
333 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00279971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  43.75 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_50996  predicted protein  45.83 
 
 
447 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  39.58 
 
 
339 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  41.67 
 
 
337 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  37.25 
 
 
380 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  38 
 
 
330 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5306  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.82 
 
 
297 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.764434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4231  chaperone DnaJ domain protein  45.83 
 
 
349 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
386 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.78 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  41.67 
 
 
340 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  37.5 
 
 
294 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  37.5 
 
 
382 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  41.67 
 
 
396 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
374 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
387 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 
374 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.67 
 
 
289 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  39.58 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 
396 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02351  DnaJ-like molecular chaperone  32.73 
 
 
312 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>