More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2455 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  51.21 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  51.21 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  48.33 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  50.83 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  50.63 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  48.7 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  49.61 
 
 		 276 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  53.78 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  50.21 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  50.21 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  50.21 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  50.21 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  50.21 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  50.21 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  44.92 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  46.64 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  45.34 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  46.39 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  44.49 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  48.21 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  45.9 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  45.71 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  45.57 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  47.9 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  44.44 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  44.21 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  42.5 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  41.76 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  41.76 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  43.4 
 
 		 265 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  44.27 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  44.27 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  41.8 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  42.69 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  45.15 
 
 		 257 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  42.05 
 
 		 264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  41.8 
 
 		 259 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  41.67 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  45.85 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  41 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  44.32 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  41.76 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  43.28 
 
 		 264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  43.04 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  41.13 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  39.39 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  43.85 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  41.6 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  42.56 
 
 		 529 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  47.73 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  44.07 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  44.54 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  39.69 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  45.31 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  40.23 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  42.74 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  42.4 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  43.04 
 
 		 262 aa  192  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  43.29 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  41.91 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  44.3 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  42.86 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  39.34 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  42.74 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  44.3 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  44.3 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.7 
 
 		 268 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  40.42 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.74 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  42.74 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  42.74 
 
 		 271 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  42.74 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  39.41 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  42.74 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  39.77 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  42.74 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  44.77 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  42.32 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.51 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0778  lipoprotein YaeC  39.92 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  39.39 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.6 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  40.62 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.91 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  42.37 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  42.19 
 
 		 257 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  43.04 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  39.66 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  40.83 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  41.91 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  43.04 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  43.04 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  40 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.75 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>