More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1934 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  100 
 
 		 190 aa  362  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  69.44 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  58.56 
 
 		 203 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  57.14 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  57.87 
 
 		 197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5252  cytochrome B561  58.94 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  46.15 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  41.45 
 
 		 222 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  43.78 
 
 		 441 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  40.62 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  43.01 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  40.74 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  41.08 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  43.33 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  43.52 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  41.44 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  41.15 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  40.62 
 
 		 186 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  41.21 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  41.21 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  37.91 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  41.21 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  38.17 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  37.97 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.25 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  38.71 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  41.62 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  40.64 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.01 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.43 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  40.33 
 
 		 421 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  42.95 
 
 		 416 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  40.53 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  45.71 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  39.67 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  42.22 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  44.04 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.92 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  35.45 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.43 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.31 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  39.56 
 
 		 420 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.78 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.69 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  38.25 
 
 		 183 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  34.95 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.89 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  35.36 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  44.26 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  34.08 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  35.94 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  34.78 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  39.56 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1066  cytochrome B561  40.33 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  38.42 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  42.7 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  37.16 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  36.81 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  38.89 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  38.59 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  39.13 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.68 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  39.13 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.68 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.68 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.68 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  34.21 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  33.68 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.93 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  33.68 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  33.68 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  33.68 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.16 
 
 		 213 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  38.59 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  35.03 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  38.25 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36.81 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  36.07 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  37.3 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  37.99 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  35.23 
 
 		 191 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  36.13 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  35.63 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  35.96 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  29.83 
 
 		 173 aa  87.8  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  34.25 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  37.57 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  37.22 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  35.91 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  41.67 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  41.67 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  41.67 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  35.03 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  37.43 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  41.67 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  41.67 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  41.67 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  38.38 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>