More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1253 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 336 aa  681    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  49.84 
 
 		 345 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  45.85 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  43.59 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  40.85 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  42.41 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  45.37 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  45.13 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  44.08 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  42.64 
 
 		 377 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  43.31 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  41.25 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  38.3 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  45.15 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  44.05 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  44.15 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  38.86 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  40.06 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  39.57 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  42.26 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  42.39 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  39.26 
 
 		 333 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  41.35 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  38.05 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  39.02 
 
 		 344 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 		 387 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  40.79 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  39.35 
 
 		 332 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 352 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  40.39 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  39.68 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  39.14 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  39.14 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  38.83 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  39.14 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  39.14 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  39.14 
 
 		 877 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 270 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  32.36 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  32.36 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  32 
 
 		 270 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  31.75 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  31.75 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  31.18 
 
 		 270 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  35.53 
 
 		 518 aa  90.1  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.45 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  31.39 
 
 		 270 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  31.39 
 
 		 270 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  30.29 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  27.02 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  26.67 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  24.22 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.82 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.69 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>