76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  100 
 
 
298 aa  617  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  67.91 
 
 
300 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  57.58 
 
 
302 aa  361  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  59.26 
 
 
304 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  57.53 
 
 
296 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  57.04 
 
 
303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  58.19 
 
 
299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  57.84 
 
 
299 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  57.84 
 
 
299 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  49.83 
 
 
311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  50.7 
 
 
315 aa  300  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  51.88 
 
 
291 aa  299  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.05 
 
 
302 aa  285  9e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  51.58 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  47.46 
 
 
332 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  46.94 
 
 
302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  44.52 
 
 
304 aa  270  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  48.25 
 
 
306 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  49.12 
 
 
306 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  43.05 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.15 
 
 
302 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.83 
 
 
274 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.27 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  32.54 
 
 
266 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.56 
 
 
293 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.27 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.58 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.48 
 
 
284 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.63 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  24.06 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.23 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  25 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.92 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.29 
 
 
259 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.66 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.89 
 
 
257 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.99 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.89 
 
 
257 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.55 
 
 
239 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.89 
 
 
257 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.45 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.98 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.36 
 
 
257 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.71 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.82 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.87 
 
 
257 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  22.76 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  21.77 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.54 
 
 
268 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.64 
 
 
253 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.49 
 
 
275 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.23 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.23 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25.76 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.95 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  34.52 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.51 
 
 
258 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  31.31 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  31.31 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  31.31 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.27 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  31.31 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.66 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.68 
 
 
372 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  23.85 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  23.85 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.95 
 
 
275 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  23.85 
 
 
256 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.44 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25 
 
 
297 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.06 
 
 
230 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>