More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2253 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
194 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  90.21 
 
 
194 aa  344  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  91.75 
 
 
194 aa  343  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  89.18 
 
 
194 aa  336  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  88.66 
 
 
194 aa  332  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  88.66 
 
 
194 aa  332  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  88.66 
 
 
194 aa  332  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  88.66 
 
 
194 aa  332  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  90.72 
 
 
194 aa  322  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.77 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2839  neutral amino-acid efflux protein  36.13 
 
 
195 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2857  neutral amino-acid efflux protein  36.13 
 
 
195 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.719199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2755  neutral amino-acid efflux protein  36.13 
 
 
195 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0462537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2861  neutral amino-acid efflux protein  36.13 
 
 
195 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2973  neutral amino-acid efflux protein  36.13 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2731  neutral amino-acid efflux protein  35.79 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0764776  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2865  neutral amino-acid efflux protein  36.32 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010142  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1090  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.79 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0625608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2958  neutral amino-acid efflux protein  35.79 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1099  neutral amino-acid efflux protein  35.79 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0442418  normal  0.231568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2735  neutral amino-acid efflux protein  35.79 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00799309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3815  neutral amino-acid efflux protein  36.32 
 
 
195 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.799014  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02472  neutral amino-acid efflux system  35.26 
 
 
195 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02436  hypothetical protein  35.26 
 
 
195 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  32.81 
 
 
203 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 
199 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 
197 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  32.28 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  34.03 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  31.38 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  30.81 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  34.43 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  30.81 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
209 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.29 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  30.32 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
206 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.38 
 
 
209 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 
209 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  28.35 
 
 
225 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 
197 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  35.56 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  35.56 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  30.57 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.97 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  26.4 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  29.73 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
197 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  29.61 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  27.03 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  31.44 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000909  putative threonine efflux protein  33.85 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.850609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.17 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  26.63 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  27.37 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4234  hypothetical protein  31.44 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744826  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  28.12 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  29.51 
 
 
640 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  32.34 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  28.88 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  31.38 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  30.89 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0361  hypothetical protein  28.42 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  28.12 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  29.17 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  28.88 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.61 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06913  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>