More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2755 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2857  neutral amino-acid efflux protein  100 
 
 
195 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.719199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2839  neutral amino-acid efflux protein  100 
 
 
195 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25167  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2861  neutral amino-acid efflux protein  100 
 
 
195 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2755  neutral amino-acid efflux protein  100 
 
 
195 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0462537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2973  neutral amino-acid efflux protein  99.49 
 
 
195 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2731  neutral amino-acid efflux protein  85.13 
 
 
195 aa  345  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0764776  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1090  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  84.1 
 
 
195 aa  342  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0625608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2958  neutral amino-acid efflux protein  84.1 
 
 
195 aa  342  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1099  neutral amino-acid efflux protein  84.1 
 
 
195 aa  342  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0442418  normal  0.231568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2735  neutral amino-acid efflux protein  84.1 
 
 
195 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00799309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02472  neutral amino-acid efflux system  83.59 
 
 
195 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02436  hypothetical protein  83.59 
 
 
195 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2865  neutral amino-acid efflux protein  83.59 
 
 
195 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010142  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3815  neutral amino-acid efflux protein  82.56 
 
 
195 aa  338  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.799014  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  62.89 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  36.36 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  36.9 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  35.83 
 
 
194 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  35.83 
 
 
194 aa  124  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  35.83 
 
 
194 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  35.83 
 
 
194 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  35.83 
 
 
194 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  37.17 
 
 
194 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  36.13 
 
 
194 aa  121  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  36.84 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  36.84 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 
202 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 
225 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  34.92 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.04 
 
 
200 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  32.86 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  35.83 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.51 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.53 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.15 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.6 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  32.8 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  34.44 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  31.18 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  30.53 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  29.65 
 
 
640 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  33.88 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  36.29 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  32.79 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.49 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  28.42 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4757  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852741  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423256  normal  0.714667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  31.87 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  32.61 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  32.72 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.05 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.77 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.39 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2325  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.82 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  31.43 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  31.25 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  35.38 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  29.21 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  29.21 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0594  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  29.52 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  28.74 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.03 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  30.98 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6041  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.630318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>