83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1982 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 65 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  96.88 
 
 		 65 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  45.16 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  31.25 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  31.75 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0734  phage shock protein C, putative  45 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  36.07 
 
 		 244 aa  52.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  34.92 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  35.71 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  35 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  43.08 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  33.85 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  29.03 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  36.51 
 
 		 240 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  30.16 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  27.87 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.67 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  32.2 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1634  phage shock protein C, PspC  37.93 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  39.66 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  39.66 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  39.66 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 497 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  32.76 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  39.66 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  39.66 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  42.11 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  32.79 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  30.16 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  38.46 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  26.23 
 
 		 77 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2164  hypothetical protein  33.87 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.771382  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  40.35 
 
 		 119 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 		 81 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  32.2 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  34 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  33.93 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 847 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  36.84 
 
 		 582 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01260  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.93 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  30 
 
 		 170 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  26.67 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  36.21 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1948  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01283  DNA-binding transcriptional activator  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  35.48 
 
 		 119 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>