More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0638 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 294 aa  613  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  37.6 
 
 		 329 aa  192  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  36.29 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.29 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  33.85 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0632  psr protein  30.09 
 
 		 457 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.513825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1859  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 463 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00497652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.39 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0698  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 476 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 377 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2795  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.21 
 
 		 424 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.7 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.47 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.63 
 
 		 411 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2102  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.49 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.246536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.15 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2557  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 263 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2794  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.48 
 
 		 476 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000218049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  36.45 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2170  cell envelope-related function transcriptional attenuator  31.95 
 
 		 473 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.34 
 
 		 502 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  35.98 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  35.98 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.2 
 
 		 453 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.02 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  34.05 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 		 419 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  35.05 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.21 
 
 		 509 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1881  cell envelope-related function transcriptional attenuator  30.15 
 
 		 460 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.723477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  33.62 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3783  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.26 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.1003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.54 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 374 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.51 
 
 		 407 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  34.58 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  32.55 
 
 		 338 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.84 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.52 
 
 		 390 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.84 
 
 		 504 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.65 
 
 		 405 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  34.2 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  34.2 
 
 		 338 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.59 
 
 		 497 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1005  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.55 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  33.77 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.05 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0612  putative transcriptional regulator  28.94 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.86 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.06 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.33 
 
 		 383 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  33.33 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  33.33 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.43 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0598  cell envelope-related function transcriptional attenuator  30.8 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.195928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.7 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.23 
 
 		 404 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.93 
 
 		 585 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  32.62 
 
 		 505 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.99 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.48 
 
 		 404 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.12 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.66 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.34 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.83 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  33.49 
 
 		 333 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.52 
 
 		 492 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.24 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.1 
 
 		 490 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.23 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.11 
 
 		 456 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.86 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.7 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.33 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.96 
 
 		 451 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.64 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  33.02 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.45 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.25 
 
 		 414 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  33.02 
 
 		 333 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.55 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.55 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.02 
 
 		 333 aa  96.3  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.86 
 
 		 418 aa  96.3  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.28 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.14 
 
 		 436 aa  95.9  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.8 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.74 
 
 		 406 aa  95.9  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  32.56 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  32.56 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>