More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7596 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7596  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 291 aa  554  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6454  inner-membrane translocator  50.52 
 
 		 298 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0183662  hitchhiker  0.00000000352666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4104  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  33.77 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  33.68 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.71 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4115  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3820  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4424  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.58 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.29 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4249  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00770361  hitchhiker  0.0000029415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.85 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  27.82 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.14 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  27.89 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.76 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.42 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  29.76 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  33.22 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  27.63 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 652 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  31.08 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3499  urea ABC transporter, permease protein UrtB  28.37 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  31 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2267  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0641115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2949  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0837  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997014  normal  0.129004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5901  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.63 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5396  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.378795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>