More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6265 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6265  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.05074 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6667  LysR family transcriptional regulator  98.34 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6432  LysR family transcriptional regulator  98.34 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6341  LysR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 299 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0548  transcriptional regulator, LysR family  79.87 
 
 		 299 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0816  transcriptional regulator, LysR family  71.38 
 
 		 296 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4032  LysR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 297 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124672  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1674  LysR substrate-binding  70.03 
 
 		 297 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1992  transcriptional regulator, LysR family  69.7 
 
 		 297 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4113  transcriptional regulator, LysR family  53.31 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0234  LysR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 296 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6210  transcriptional regulator, LysR family  48.29 
 
 		 293 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3021  transcriptional regulator, LysR family  47.57 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4124  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.774115  decreased coverage  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  35.15 
 
 		 305 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3968  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3219  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00312841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0839  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.23 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0579  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.0538028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0547  transcriptional regulator, LysR family protein  29.63 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0604  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1993  putative transcriptional regulator  33.1 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 362 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 300 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1481  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 301 aa  138  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  35.09 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3439  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0327434  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23540  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483794 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0695  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000273507  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0846  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.579018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0839  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.771385  hitchhiker  0.0000128794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0814  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000116496  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3521  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2842  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3327  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114009  normal  0.9019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3156  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000483738  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  32.54 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5689  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3753  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4615  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0591659 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>