More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5486 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  70.66 
 
 
481 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  94.2 
 
 
483 aa  925    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
483 aa  975    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  69.17 
 
 
481 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
483 aa  975    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
483 aa  975    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  51.36 
 
 
472 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  49.79 
 
 
477 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  49.79 
 
 
477 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  50 
 
 
474 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  49.58 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  51.45 
 
 
486 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  50.31 
 
 
473 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  49.9 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  48.23 
 
 
474 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  48.02 
 
 
474 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  48.75 
 
 
472 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  48.02 
 
 
474 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  48.02 
 
 
474 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  46.89 
 
 
474 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  47.93 
 
 
474 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  46.89 
 
 
474 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  47.1 
 
 
474 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  46.78 
 
 
474 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  46.89 
 
 
474 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  49.9 
 
 
478 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  46.68 
 
 
474 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  46.47 
 
 
474 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  46.68 
 
 
474 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  46.47 
 
 
474 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  49.69 
 
 
478 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  46.56 
 
 
474 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  48.96 
 
 
477 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  48.12 
 
 
474 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  46.36 
 
 
483 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  43.12 
 
 
481 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  44.65 
 
 
486 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  46.96 
 
 
465 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  42.44 
 
 
478 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  44.47 
 
 
477 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  40.13 
 
 
480 aa  349  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  38.67 
 
 
475 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  39.63 
 
 
494 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
476 aa  318  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  33.27 
 
 
628 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  48.93 
 
 
239 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
615 aa  134  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  29.4 
 
 
616 aa  133  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.71 
 
 
486 aa  133  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  29.4 
 
 
616 aa  133  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  28.99 
 
 
605 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  21.33 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
616 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  21.56 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  21.69 
 
 
458 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  31.7 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  21.33 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  21.1 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  21.1 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
597 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  21.1 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  21.79 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
476 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  20.87 
 
 
458 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
463 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
463 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  20.64 
 
 
458 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25.15 
 
 
467 aa  123  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
438 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
438 aa  123  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
438 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
438 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
438 aa  123  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  30.52 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  32.78 
 
 
438 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
458 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  32.78 
 
 
438 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  32.48 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
477 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
504 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  34.63 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  31.44 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  24.32 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22960  putative two-component sensor  34.63 
 
 
473 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.758955  normal  0.36049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
477 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
525 aa  117  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
488 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  32.46 
 
 
499 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  35.14 
 
 
444 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.04 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>