More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5216 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  95.19 
 
 		 416 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  98.8 
 
 		 416 aa  792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  798    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  93.25 
 
 		 416 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  98.8 
 
 		 416 aa  792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  94.22 
 
 		 416 aa  728    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  93.73 
 
 		 416 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  72.04 
 
 		 451 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  70.93 
 
 		 420 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  70.15 
 
 		 420 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  53.49 
 
 		 415 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  54.64 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  58.96 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  56.89 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  51.6 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  54.5 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  53.6 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  50 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  53.9 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  53.9 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  53 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  52.85 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  53.92 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  53.16 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  53.02 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  52 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  51.99 
 
 		 412 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  52.13 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  56.5 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  50.48 
 
 		 408 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 416 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  48.86 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  47.61 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  51 
 
 		 415 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  48.15 
 
 		 418 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  50 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  52.97 
 
 		 397 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 421 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  54.48 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  45.5 
 
 		 413 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  47.34 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  48.87 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  50 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  50 
 
 		 404 aa  316  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 428 aa  315  9e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  49.75 
 
 		 411 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 		 412 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  45.32 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 429 aa  292  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  44.39 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  44.04 
 
 		 457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  41.94 
 
 		 433 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  42.29 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 411 aa  277  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  42.79 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 401 aa  262  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  41.87 
 
 		 421 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  39.85 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  40 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  44.91 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  38.37 
 
 		 424 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  39.43 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 437 aa  242  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  38.2 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  39.32 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 414 aa  223  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 415 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  32.44 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 449 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  29.57 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  28.95 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>