More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3445 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3445  alanine racemase  100 
 
 		 373 aa  753    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  95.44 
 
 		 373 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  93.03 
 
 		 373 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4288  alanine racemase  98.66 
 
 		 373 aa  745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3976  alanine racemase  94.64 
 
 		 373 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.087726  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3490  alanine racemase  94.64 
 
 		 373 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.541285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4078  alanine racemase  98.66 
 
 		 373 aa  745    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  80.27 
 
 		 374 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  80.21 
 
 		 374 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2286  alanine racemase  79.95 
 
 		 374 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  80.21 
 
 		 374 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1238  alanine racemase  62.89 
 
 		 356 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1371  alanine racemase  62.26 
 
 		 375 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0951593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3234  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1575  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2603  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.139768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2514  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2458  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181694  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1350  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313664  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6038  alanine racemase  62.61 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.629705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2078  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2039  alanine racemase  62.61 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2058  alanine racemase  62.32 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0773108  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5348  alanine racemase  62.32 
 
 		 356 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2007  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.954073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1359  alanine racemase  63.46 
 
 		 363 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.766963  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2071  alanine racemase  62.61 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  62.32 
 
 		 356 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1934  alanine racemase  62.78 
 
 		 373 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1400  alanine racemase  61.56 
 
 		 368 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124508  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1244  alanine racemase  61.2 
 
 		 374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.43414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1310  alanine racemase  61.5 
 
 		 374 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2477  alanine racemase  63.46 
 
 		 356 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0200265  hitchhiker  0.000141057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1660  alanine racemase  62.61 
 
 		 356 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377716  normal  0.0463479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  58.15 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  57.87 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  58.15 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  58.15 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  58.15 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  58.15 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  58.15 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  58.15 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1940  alanine racemase  56.5 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2745  alanine racemase  57.51 
 
 		 357 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  56.21 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  56.21 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  55.93 
 
 		 356 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  55.93 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0131  alanine racemase  57.69 
 
 		 365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0193  alanine racemase  58.29 
 
 		 364 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.326654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0176  alanine racemase  58.68 
 
 		 365 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  54.49 
 
 		 356 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0194  alanine racemase  58.68 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0253  alanine racemase  58.15 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.501756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3562  alanine racemase  56.79 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0229  alanine racemase  57.22 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0311  alanine racemase  54.37 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0920  alanine racemase  54.45 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0488  alanine racemase  53.49 
 
 		 374 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2530  alanine racemase region  55.08 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4337  alanine racemase  53.13 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  53.12 
 
 		 357 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1986  alanine racemase region  54.73 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.334037 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0919  alanine racemase  49.04 
 
 		 374 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  51.97 
 
 		 367 aa  339  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2115  alanine racemase  52.26 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000357535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0923  alanine racemase  47.95 
 
 		 381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  52.41 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  50.57 
 
 		 361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  48.9 
 
 		 362 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  48.73 
 
 		 357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  49.3 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  47.59 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  49.3 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  49.3 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  45.92 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  47.31 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  45.89 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  45.07 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  45.89 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  47.47 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  44.41 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  45.33 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  44.17 
 
 		 365 aa  282  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  45.04 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  44.92 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  45.04 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  38.31 
 
 		 364 aa  279  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  44.32 
 
 		 358 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  38.03 
 
 		 364 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  44.48 
 
 		 358 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  44.48 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  44.48 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  45.32 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  45.32 
 
 		 359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  45.32 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  44.19 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  41.76 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  43.06 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  42.12 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>