More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4645 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 265 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 265 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  96.6 
 
 		 265 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  84.86 
 
 		 286 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  79.86 
 
 		 288 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  80 
 
 		 280 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  78.95 
 
 		 285 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  59.45 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  59.45 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  57.78 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  57.47 
 
 		 259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  57.69 
 
 		 277 aa  285  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  56.13 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  56.13 
 
 		 277 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  52.04 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  55.73 
 
 		 390 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  55.16 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  52.01 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  41.35 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  40.25 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  38.93 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  36.4 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  34.16 
 
 		 287 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  39.24 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  36.93 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  34.01 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  32.92 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  32.19 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  31.76 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  30.87 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  26.77 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  24.47 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  23.85 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.85 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.65 
 
 		 374 aa  58.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 325 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.57 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  22.18 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  22.18 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.57 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  25 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  22.18 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  22.18 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.71 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  21.35 
 
 		 562 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  27.82 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  28.05 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>