More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2723 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2723  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 347 aa  686    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1295  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  41.74 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3452  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 		 359 aa  186  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3382  transcriptional regulator, LacI family  41.48 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3098  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.86 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4981  transcriptional regulator, LacI family  45.61 
 
 		 253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00303517  hitchhiker  0.00602163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2515  transcriptional regulator, LacI family  34.67 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185479  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  30.32 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0292  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00151755  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  29.46 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  40.99 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  28.18 
 
 		 336 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.85 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 335 aa  96.3  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 360 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1875  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.75 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.398277  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1438  transcriptional regulator, LacI family  28.34 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  23.43 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  29.68 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  30.6 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  27.3 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  31.5 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.3 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 368 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.52 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  32.4 
 
 		 348 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  28.41 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  23.35 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3042  LacI family transcription regulator  29.72 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000688276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  33.47 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  31.39 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  29.35 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  31.37 
 
 		 334 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  32.57 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  31.33 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  32.5 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  30.43 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.01 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  26.48 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  29.96 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  31.6 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  33.57 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  32.29 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  29.7 
 
 		 340 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.81 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 361 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.73 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3995  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 352 aa  86.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  28.93 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  31.87 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  28.48 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 358 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  24.66 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  27.49 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  28.39 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  30.69 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  28.5 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  29.39 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  29.29 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  27.81 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  28.36 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  32.6 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1755  LacI family transcription regulator  29.21 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.998653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  31.69 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  26.15 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>