More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1147 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1147  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
295 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4896  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.65 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0462854  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.79 
 
 
290 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53721  normal  0.207776 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
258 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
279 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0326  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
279 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
279 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246664 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.28 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.35 
 
 
281 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312689  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 
281 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.77 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  33.33 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4503  reductase  38.06 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
288 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1517  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
263 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0374  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  24.53 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.333975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3453  short chain dehydrogenase  30.47 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5275  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  30.22 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  21.93 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21608  predicted protein  26.22 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  28.32 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1874  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.57 
 
 
245 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00756891  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  29.55 
 
 
251 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0872  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.24 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1924  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588945  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3256  malate/L-lactate dehydrogenase  40.78 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0180309  normal  0.2268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.27 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.63 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
247 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
244 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2733  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.02 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2585  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
239 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00764889  hitchhiker  0.0046637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.84 
 
 
238 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283409  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07750  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  26.54 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.370743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.74 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000715788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
238 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.94 
 
 
252 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2450  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.97 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0588797  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  27.84 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  27.44 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.84 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  27.17 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  25.74 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.74 
 
 
238 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.47 
 
 
248 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.46 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.46 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.46 
 
 
274 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.89 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 
253 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5588  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3280  short chain dehydrogenase  29.81 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2516  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  25.79 
 
 
248 aa  53.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.07 
 
 
254 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
241 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959898  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
262 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
253 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
276 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
281 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
251 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893367  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2949  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.27 
 
 
255 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02709  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.31 
 
 
247 aa  52.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0811228  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
281 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
281 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627142  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.26 
 
 
255 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7112  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
248 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
244 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
240 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622765  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
240 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191512  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.5 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.533949  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  27 
 
 
255 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
252 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.298232  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  25.64 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>