More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0739 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
504 aa  934    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  43.14 
 
 
495 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  41.77 
 
 
483 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  44.34 
 
 
462 aa  272  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 
498 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 
464 aa  240  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  36.98 
 
 
469 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  38.84 
 
 
465 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  35.05 
 
 
461 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 
489 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  27.9 
 
 
468 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  36.6 
 
 
462 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 
515 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 
452 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  43.71 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  49.08 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  56.17 
 
 
465 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  34.35 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 
497 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  27.36 
 
 
487 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  34.86 
 
 
539 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 
243 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.04 
 
 
489 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 
495 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
491 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.06 
 
 
491 aa  97.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
491 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 
495 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.27 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.92 
 
 
500 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.38 
 
 
517 aa  94.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  26.42 
 
 
486 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  24.77 
 
 
500 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  33.72 
 
 
490 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 
501 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
548 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.98 
 
 
538 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  33.99 
 
 
494 aa  90.9  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
484 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.56 
 
 
569 aa  90.1  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
489 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 
537 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 
565 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
449 aa  87.4  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.18 
 
 
523 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 
702 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.52 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.77 
 
 
555 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.64 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1177  MFS permease  28.91 
 
 
520 aa  84  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5733  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.883697  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 
508 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  27.59 
 
 
474 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 
506 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.4 
 
 
485 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
448 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 
918 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 
541 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 
685 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.47 
 
 
513 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  27.84 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  29.17 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.48 
 
 
685 aa  80.5  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.99 
 
 
522 aa  80.5  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1255  major facilitator transporter  32.53 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269509  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  32.24 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.59 
 
 
641 aa  80.1  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 
562 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 
676 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 
685 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  30.18 
 
 
511 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  33.33 
 
 
497 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 
519 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
890 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000517573  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 
684 aa  79.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.48 
 
 
513 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.07 
 
 
504 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.69 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  30.23 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  21.69 
 
 
513 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  21.69 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.13 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.69 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  21.69 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 
682 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  27.85 
 
 
501 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  21.48 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 
682 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 
682 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  22.13 
 
 
513 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 
592 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 
511 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  28.25 
 
 
537 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.07 
 
 
498 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.074494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>