104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4075 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 62 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  96.67 
 
 		 62 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  95.08 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  95.08 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  95.08 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  91.8 
 
 		 62 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  91.53 
 
 		 62 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  81.67 
 
 		 61 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  80 
 
 		 61 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  68.85 
 
 		 62 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  70.49 
 
 		 62 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  67.21 
 
 		 62 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  67.21 
 
 		 62 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  67.21 
 
 		 62 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 		 62 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  61.67 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  63.33 
 
 		 62 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  65 
 
 		 62 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  65 
 
 		 62 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  56.67 
 
 		 63 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  58.33 
 
 		 62 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  58.33 
 
 		 63 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  55 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  48.33 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45.16 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.33 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.27 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.27 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.33 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  47.27 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.64 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  44.64 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1634  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  38.18 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1139  4-oxalocrotonate tautomerase  42.11 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0208  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0443  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3872  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 65 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  31.15 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.84 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4605  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6731  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0829  4-oxalocrotonate tautomerase  36.21 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  32.79 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0226  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00511525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.93 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05436  hypothetical protein  34.43 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4596  4-oxalocrotonate tautomerase  30 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.93 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0593  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  35.09 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 		 80 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  33.33 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3103  4-oxalocrotonate tautomerase  28.33 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3425  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  28.33 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08690  4-oxalocrotonate tautomerase  35.85 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2946  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0235  4-oxalocrotonate tautomerase  37.04 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>