31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2485 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
62 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  58.06 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  48.39 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  51.61 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  44.44 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  37.7 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  42.86 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  41.27 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  36.51 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  38.78 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.73 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  38.78 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  34.69 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.09 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  29.09 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  30.91 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  35.42 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.18 
 
 
244 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>