28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2719 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 68 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  65.67 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  42.65 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  51.61 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  44.12 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  47.06 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  38.24 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  44.78 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  36.76 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  42.65 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  37.31 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  33.82 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  36.76 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  40.35 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2590  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2634  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  41.18 
 
 		 62 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  37.25 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  38.18 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.35 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  29.82 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.58 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  31.58 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 		 63 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>