65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2075 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
127 aa  249  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  75.59 
 
 
127 aa  197  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  56.25 
 
 
128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  58.59 
 
 
128 aa  151  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  41.86 
 
 
129 aa  117  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  36.8 
 
 
128 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  36 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  37.6 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  36.92 
 
 
129 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  42.65 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 
244 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  40.57 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
62 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  32.58 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  36.97 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  36.97 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  30.51 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  30.51 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  29.85 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  25.49 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  25.96 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  28.44 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  27.45 
 
 
127 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  27.45 
 
 
127 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  27.45 
 
 
127 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  29.9 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  29.09 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  28.18 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  28.18 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  21.5 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  28.43 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  27.97 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  28.18 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  25.96 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  27.97 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  27.97 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  27.97 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  27.97 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.85 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  27.97 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  27.97 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  27.97 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  26.67 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  20.56 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  26.67 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  20 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  20 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  20 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.48 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  20 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  20 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  31 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  25.83 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  20 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  24.78 
 
 
127 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  29.36 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32.79 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  31.53 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  26.27 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  26.97 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  31.03 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  27.73 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>