50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1717 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  268  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  48.85 
 
 
131 aa  134  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  40.31 
 
 
128 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  36.92 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2634  hypothetical protein  50.7 
 
 
76 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258178  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2590  hypothetical protein  50.7 
 
 
76 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  31.97 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  28.46 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  29.6 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  28.1 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 
127 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  28.89 
 
 
129 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  27.42 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  30.77 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  23.97 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  27.05 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  27.05 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2627  hypothetical protein  47.83 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  28.1 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  27.05 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  33.82 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  24.56 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  25.23 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  28.1 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  23.77 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  24.59 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  23.08 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.7 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  23.28 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  23.28 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  23.89 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  23.28 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  27.05 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  23.08 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  25.62 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  26.23 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  22.22 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  20.8 
 
 
244 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  23.14 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  25.41 
 
 
127 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
63 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>