17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1002 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  100 
 
 
128 aa  269  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  93.75 
 
 
128 aa  253  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  77.34 
 
 
128 aa  216  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  44.88 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  36 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  37.8 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  33.6 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  27.56 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  44.78 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  22.32 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.89 
 
 
244 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  25.23 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  28.32 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  26.47 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  28 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  32.65 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>