43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2262 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  266  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  44.88 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  44.88 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  42.52 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  41.86 
 
 
127 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  44.19 
 
 
128 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  38.76 
 
 
128 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  35.66 
 
 
127 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  65.67 
 
 
68 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  58.06 
 
 
62 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  43.66 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  31.82 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  28.89 
 
 
129 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2590  hypothetical protein  37.68 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2634  hypothetical protein  37.68 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258178  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  30.63 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  30.63 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
244 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  30.77 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  43.75 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  27.18 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  31.58 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  28.17 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  33.96 
 
 
70 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  30.21 
 
 
126 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  27 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
126 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  24.27 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  24.27 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  24.27 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  22 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  24.04 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  26 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  26 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  26 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  26 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  26 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  26 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  26 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  26.21 
 
 
132 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  21.78 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  29.59 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>