66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1896 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  41.8 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  41.8 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  41.8 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  41.8 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  38.52 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  37.19 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  39.34 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  36.89 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  37.7 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  37.7 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  37.7 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  38.84 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  33.61 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  35.54 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  34.15 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  34.15 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  34.15 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  33.06 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  32.06 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  30.58 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  30.58 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  34.13 
 
 		 272 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  33.65 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  29.55 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  30.53 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  26.28 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  29.81 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  28.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  27.88 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  28.46 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  28.1 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  28.3 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  28.3 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  28.3 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  27.78 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  26.02 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.23 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  26.45 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  25 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  29.06 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  29.46 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  26.02 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  29.75 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  25.4 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  26 
 
 		 128 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  29.59 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>