17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  58.59 
 
 		 127 aa  151  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  57.03 
 
 		 127 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  51.59 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  29.92 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  30.71 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  27.56 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  36.76 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  31.06 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  28.46 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  29.41 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  29.7 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  29.41 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>