22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2138 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
127 aa  251  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  75.59 
 
 
127 aa  197  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  58.59 
 
 
128 aa  155  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  57.03 
 
 
128 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  35.66 
 
 
129 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  36 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  34.4 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  33.6 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  38.24 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  31.97 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  36.13 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  34.09 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  20.66 
 
 
244 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  29.9 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  30.69 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  30.69 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  30.69 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.21 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  23.58 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  33.33 
 
 
63 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>