70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2646 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  100 
 
 
130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  57.14 
 
 
126 aa  158  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  53.17 
 
 
127 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  53.17 
 
 
127 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
127 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
127 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  49.6 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  49.21 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  46.83 
 
 
126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  44.8 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  46.03 
 
 
126 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  45.24 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  43.65 
 
 
127 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  43.65 
 
 
126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  43.65 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  43.65 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  43.65 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  43.65 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  42.06 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 
127 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  42.06 
 
 
126 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 
127 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  40 
 
 
127 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
127 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  40 
 
 
127 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
127 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  40 
 
 
127 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
127 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
127 aa  105  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  40 
 
 
127 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  39.52 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  36.8 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
124 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  39.2 
 
 
134 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  36.51 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
136 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  32.54 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  27.59 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  27.59 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  27.59 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  32.54 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  29.6 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  33.06 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  31.2 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  32.28 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  28 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  29.37 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  26.72 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  29.37 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.56 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  29.46 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  28.97 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  29.41 
 
 
129 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  29.6 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 
272 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0609  tautomerase  24.39 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  26.09 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  21.6 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  29.75 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  35.85 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  43.75 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  31 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  26 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>