56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4034 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  91.7 
 
 		 267 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  88.76 
 
 		 267 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  97.97 
 
 		 246 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  91.13 
 
 		 249 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  91.13 
 
 		 249 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  91.13 
 
 		 249 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  61.11 
 
 		 238 aa  298  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  63.2 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  64.58 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  64.58 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  54.25 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  56.72 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  55.46 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  50.87 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  54.43 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  54.47 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  57.51 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  54.47 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  55.51 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  49.33 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  52.3 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  52.32 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  50.63 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  47.84 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  45.42 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  52.12 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  45.8 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  43.46 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  52.17 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  42.92 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  45.68 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  51.52 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  43.75 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  43.08 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  48.76 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  51.35 
 
 		 252 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  50.22 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  44.17 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  50.84 
 
 		 194 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  45.85 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  45.34 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.23 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  62.71 
 
 		 61 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  45.83 
 
 		 123 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  50.72 
 
 		 83 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  29.82 
 
 		 309 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  26.61 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  26.75 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  34.07 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.02 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  21.33 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  25.96 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  27 
 
 		 247 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>