44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1441 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  44.22 
 
 		 270 aa  144  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  47.06 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  48.99 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  49.69 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  43.62 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  46.21 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  44.83 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  46.67 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  44.83 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  44.83 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  42.66 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  42.66 
 
 		 159 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  44.38 
 
 		 264 aa  121  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  42.66 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  46.28 
 
 		 203 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  37.67 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  38.3 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  41.96 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  35.95 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  37.93 
 
 		 150 aa  95.5  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  33.74 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  33.57 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  28.39 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  34.93 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  31.52 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  29.57 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.91 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  32.2 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  29.69 
 
 		 130 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  29.27 
 
 		 124 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  28.57 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  30.89 
 
 		 124 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  35.29 
 
 		 122 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  30.08 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  29.84 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  32.79 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  29.27 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.3 
 
 		 128 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  30.77 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  32.76 
 
 		 124 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  34.17 
 
 		 160 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  26.49 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>