37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29070 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  324  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  56.86 
 
 		 176 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  57.24 
 
 		 175 aa  190  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  56.58 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  60.81 
 
 		 169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  58.55 
 
 		 175 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  50.33 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  47.62 
 
 		 270 aa  145  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  48.39 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  46.15 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  48.28 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  47.55 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  48.28 
 
 		 192 aa  134  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  43.42 
 
 		 170 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  49.32 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  44.16 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  48.99 
 
 		 264 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  37.96 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  37.93 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  34.97 
 
 		 192 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  41.96 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  37.01 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  40.41 
 
 		 188 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  32.67 
 
 		 191 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  40.94 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  40.32 
 
 		 203 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  35.8 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  36.48 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  32.08 
 
 		 314 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  32.17 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  30.5 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  27.13 
 
 		 130 aa  44.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  28.95 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  30.28 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  29.09 
 
 		 124 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  29.09 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>