28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1580 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  635    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  32.08 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  31.13 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  30.19 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  31.37 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  29.29 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  27.35 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  32.99 
 
 		 168 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  26.96 
 
 		 177 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  33.78 
 
 		 175 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  27.66 
 
 		 189 aa  49.3  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  49.3  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  28.43 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  27.17 
 
 		 164 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  26.83 
 
 		 169 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  30.43 
 
 		 133 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  35.29 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  27.34 
 
 		 170 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  34.15 
 
 		 179 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  24.47 
 
 		 184 aa  45.8  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  22.54 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  30.69 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  26.96 
 
 		 124 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  27.05 
 
 		 150 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  27.17 
 
 		 129 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  24.03 
 
 		 126 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  31.08 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>