39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1415 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  61.49 
 
 		 172 aa  197  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  50.96 
 
 		 192 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  55.47 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  50.33 
 
 		 191 aa  148  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  43.36 
 
 		 170 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  42.28 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  40.97 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  41.61 
 
 		 169 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  41.96 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  44.37 
 
 		 192 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  41.67 
 
 		 270 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  39.31 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  39.31 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  43.56 
 
 		 187 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  43.64 
 
 		 201 aa  103  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  37.91 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  39.16 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  38.19 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  36.73 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  37.76 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  39.2 
 
 		 179 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  41.96 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  37.76 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  40.5 
 
 		 203 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  39.67 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  34.48 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  29.17 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  27.05 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.33 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.51 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  27.35 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  31 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  26.36 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  31.37 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  23.93 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.67 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.88 
 
 		 175 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>