30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2462 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  93.14 
 
 		 175 aa  337  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  92.57 
 
 		 176 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  84.57 
 
 		 175 aa  296  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  61.04 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  57.24 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  50 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  47.8 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  44.38 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  44.79 
 
 		 189 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  40.36 
 
 		 270 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  43.54 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  44.06 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42.66 
 
 		 170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  46.94 
 
 		 264 aa  121  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  41.61 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  42.58 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  40.41 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  31.93 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  44.44 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  38.1 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  31.87 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  36.67 
 
 		 154 aa  87.8  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  39.16 
 
 		 150 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  31.58 
 
 		 160 aa  84.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  31.32 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  32.7 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  32.08 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  27.69 
 
 		 124 aa  40.8  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>