29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0553 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  50.6 
 
 		 160 aa  161  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  49.4 
 
 		 192 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  42.7 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  50.33 
 
 		 150 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  39.69 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  42.42 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  37.42 
 
 		 170 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  39.87 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  31.93 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  33.72 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  30.81 
 
 		 176 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  35.47 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  30.81 
 
 		 175 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  34.08 
 
 		 270 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  32.91 
 
 		 159 aa  87.8  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  30.87 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  32.57 
 
 		 175 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  32.26 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  34 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  32.67 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  35.71 
 
 		 264 aa  74.7  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  28.31 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  30.67 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  22.29 
 
 		 314 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  31.48 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>