37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0595 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  348  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  43.83 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  49.59 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  44.16 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  41.21 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  38.12 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  37.84 
 
 		 270 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  40.41 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  39.86 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  35.8 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  40.14 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  37.91 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  39.86 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  39.16 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  36.59 
 
 		 192 aa  103  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  41.96 
 
 		 177 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  37.84 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  35.71 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  41.04 
 
 		 203 aa  94.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  42.57 
 
 		 188 aa  94.4  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  39.16 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  31.93 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  35.71 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  39.67 
 
 		 264 aa  87.8  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  32.68 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  29.65 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  32.99 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  27.18 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  34.34 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  36.14 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  34.48 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.85 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  29.17 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  29.59 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  28.41 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  35.56 
 
 		 122 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  32.18 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>