29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2917 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  330  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  50.6 
 
 		 191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  50.74 
 
 		 172 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  45.58 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  55.47 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  44.03 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  36.36 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  37.91 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  34.29 
 
 		 173 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  33.33 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  33.82 
 
 		 270 aa  90.9  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  34.78 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  34.81 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  33.54 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  37.88 
 
 		 177 aa  87.8  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  37.98 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  36.29 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  30.92 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  38.81 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  36.8 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  39.84 
 
 		 264 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  32.14 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  38.36 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  30.77 
 
 		 314 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  26.47 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>