29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2300 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  100 
 
 		 164 aa  333  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  65.15 
 
 		 203 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  45.03 
 
 		 189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  37.35 
 
 		 270 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  41.61 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  42.14 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  41.13 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  39.42 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  39.42 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  42.07 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  40.88 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  38.97 
 
 		 192 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  39.57 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  41.13 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  37.25 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  42.62 
 
 		 264 aa  100  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  39.71 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  39.32 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  88.2  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  34.97 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  35.92 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  29.95 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  29.49 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  28.31 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  25.62 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  27.17 
 
 		 314 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>