31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3475 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  98.29 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  92.57 
 
 		 175 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  81.14 
 
 		 175 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  61.04 
 
 		 169 aa  208  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  56.86 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  47.8 
 
 		 173 aa  154  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  49.32 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  44.94 
 
 		 192 aa  144  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  40.85 
 
 		 270 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  46.81 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  44.68 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  42.18 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  40.43 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  47.11 
 
 		 264 aa  120  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  46.61 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  39.42 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  41.67 
 
 		 188 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  39.86 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  41.61 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  30.81 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  34.38 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  39.31 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  30.63 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  87.8  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  30.92 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  32.43 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  30.19 
 
 		 314 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  27.12 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  25.98 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>