32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1448 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1448  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1415  hypothetical protein  61.49 
 
 
150 aa  168  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0753464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0493  hypothetical protein  46.01 
 
 
192 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0553  hypothetical protein  42.7 
 
 
191 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2917  hypothetical protein  50.74 
 
 
160 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.582849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  40.76 
 
 
173 aa  124  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0128  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  40 
 
 
170 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1442  hypothetical protein  38.41 
 
 
189 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000142032  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1333  hypothetical protein  41.06 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.419421  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0595  hypothetical protein  35.8 
 
 
168 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.5318399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2580  hypothetical protein  37.33 
 
 
270 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2411  hypothetical protein  40.67 
 
 
192 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1990  hypothetical protein  37.41 
 
 
169 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0471488  normal  0.098607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3219  hypothetical protein  38 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.289131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0266  hypothetical protein  37.35 
 
 
187 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00510012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0281  hypothetical protein  37.72 
 
 
201 aa  98.6  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.534278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2462  hypothetical protein  38.1 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2296  hypothetical protein  35 
 
 
175 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3475  hypothetical protein  34.38 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189272  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2471  hypothetical protein  36.54 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623057  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1441  hypothetical protein  36 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0147619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29070  hypothetical protein  37.01 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02980  putative transmembrane protein  31.82 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174988  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4703  hypothetical protein  39.53 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262832  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2300  signal peptide protein  35.92 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3887  hypothetical protein  34.67 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2622  hypothetical protein  31.51 
 
 
188 aa  58.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00347  hypothetical protein  27.63 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  28.81 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  27.88 
 
 
160 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1580  hypothetical protein  25 
 
 
314 aa  40.8  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528677  normal  0.0547488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  29.79 
 
 
140 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>