More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3404 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  303  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  85.9 
 
 		 156 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  84.52 
 
 		 152 aa  253  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  84.52 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  72.59 
 
 		 152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  63.87 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  63.23 
 
 		 152 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  64.89 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  52.9 
 
 		 159 aa  146  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2990  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645103  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0226  MerR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0208  MerR family regulatory protein  51.35 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7803  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  51.91 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7475  MerR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 145 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1697  MerR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4304  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2821  MerR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5680  MerR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 171 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6044  MerR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 171 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  42.48 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  39.72 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  39.32 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.86 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  51.32 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.86 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  50.75 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  49.25 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  49.25 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  38.1 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  38.52 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.39 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.76 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3704  MerR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  33.79 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  43.24 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  44.9 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  37.41 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  36 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  36.72 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  37.41 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  35.77 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  34.96 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  48.53 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  52.24 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  40.79 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>