60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3356 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  97.06 
 
 		 313 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  85.29 
 
 		 313 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  84.92 
 
 		 313 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  84.92 
 
 		 313 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  84.26 
 
 		 313 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  69.51 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  65.47 
 
 		 314 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  65.15 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  67.1 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  65.8 
 
 		 315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  59.54 
 
 		 314 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  59.54 
 
 		 314 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  59.74 
 
 		 313 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  33.02 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  33.66 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  36.13 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  34.97 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  34.97 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  34.97 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  35.16 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  35.16 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  33.44 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  33.44 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  33.44 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  33.44 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  33.44 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  33.44 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  33.44 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  34.45 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  32.18 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  32.66 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  32.02 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  32.67 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  32.02 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.98 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  38.05 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  31.97 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  32.49 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  31.46 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  35.05 
 
 		 578 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  31.19 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.79 
 
 		 927 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  32.01 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  29.7 
 
 		 400 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  34.39 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  30.26 
 
 		 560 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0254  cytochrome b5  29.66 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 		 649 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  31.66 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  19.5 
 
 		 544 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  29.08 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  33.64 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  35.23 
 
 		 588 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  30.94 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  19.67 
 
 		 439 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0269  cytochrome b5  27.12 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.907085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  19.67 
 
 		 544 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  19.67 
 
 		 544 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>