90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1107 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1107  cytochrome b561  100 
 
 		 210 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0878902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4333  cytochrome B561  95.24 
 
 		 210 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0743  cytochrome B561  89.52 
 
 		 210 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.689612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1224  cytochrome B561  89.52 
 
 		 210 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1107  cytochrome b561  88.57 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.342144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1197  cytochrome b561  88.57 
 
 		 210 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0202339  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0667  hypothetical protein  79.29 
 
 		 366 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0485  hypothetical protein  79.29 
 
 		 366 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1404  hypothetical protein  79.29 
 
 		 378 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1200  hypothetical protein  79.29 
 
 		 378 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0949827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3086  hypothetical protein  79.29 
 
 		 361 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1399  hypothetical protein  79.29 
 
 		 374 aa  310  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1532  hypothetical protein  78.79 
 
 		 373 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2841  hypothetical protein  80.2 
 
 		 336 aa  298  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2667  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  74.02 
 
 		 213 aa  298  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5019  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  66.04 
 
 		 212 aa  278  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.211466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2178  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  65.71 
 
 		 208 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2989  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  61.46 
 
 		 210 aa  256  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1519  hypothetical protein  63.54 
 
 		 201 aa  248  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6423  cytochrome b561  64.58 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0308  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  66.32 
 
 		 224 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.534278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3135  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  61.9 
 
 		 217 aa  237  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0243  hypothetical protein  56.67 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2591  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B-type subunit oxidoreductase protein  65.1 
 
 		 198 aa  234  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1509  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  61.58 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0296  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  66.32 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0619  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  60.61 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3599  hypothetical protein  60.48 
 
 		 209 aa  221  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.927572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0542  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit oxidoreductase protein  58.1 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1202  thiosulfate reductase cytochrome b subunit (membrane anchoring protein)  59.8 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2729  hypothetical protein  64.06 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6765  putative transmembrane hydrogenase cytochrome b-type subunit  60.21 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0486  hypothetical protein  55.17 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0337  hypothetical protein  54.76 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  0.0250928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0332  hypothetical protein  54.55 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2995  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  55.96 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0962  hypothetical protein  52.85 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0222  hypothetical protein  52.11 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3724  HupC/HyaC/HydC family protein  53.37 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1751  hypothetical protein  57.29 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172426  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1696  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4931  hypothetical protein  57.29 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3601  hypothetical protein  53.09 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1496  HupC/HyaC/HydC family protein  51.01 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3372  hypothetical protein  54.34 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.356958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2750  hypothetical protein  48.22 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4896  hypothetical protein  47.74 
 
 		 225 aa  154  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.887207  decreased coverage  0.000752171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3285  hypothetical protein  46.23 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64550  hypothetical protein  54.49 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5605  hypothetical protein  55.09 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1559  Thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  37.56 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3629  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2312  hypothetical protein  39.49 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4303  hypothetical protein  37.04 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4165  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  34.47 
 
 		 242 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  33.83 
 
 		 242 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0959  hypothetical protein  31.35 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  29.14 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4243  hypothetical protein  31 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  28.74 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  37.13 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  28.85 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.8 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  38.28 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  38.28 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  35.95 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  28.76 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  26.32 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4105  HupC/HyaC/HydC family protein  33.59 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.42 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4345  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  29.58 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.159228  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.06 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  28.92 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2295  hypothetical protein  30.17 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.61 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1277  cytochrome B561  23.35 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.258136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1576  cytochrome b561  25.26 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2741  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  24.73 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2865  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.06 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3510  putative transmembrane b-type cytochrome protein  26.03 
 
 		 290 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  29.33 
 
 		 366 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02800  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)  30.5 
 
 		 544 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2740  cytochrome B561  25.52 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000653715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0660  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.34 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0549126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6558  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.75 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892588  hitchhiker  0.000719745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1972  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.13 
 
 		 246 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.184335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2551  formate dehydrogenase gamma subunit  28.57 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233004  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0593  hypothetical protein  25.76 
 
 		 218 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000727349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0863  Ni/Fe-hydrogenase, B-type cytochrome subunit  22.28 
 
 		 221 aa  42  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.627078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>